转移性葡萄膜黑色素瘤（mUM）的前景并不乐观，治疗选择有限。MET激酶在mUM上过度表达，先前的研究表明MET抑制剂卡博替尼（CABO）对肿瘤有抑制作用。A091201是一项2期临床研究，随机入组患者，评估了CABO（每日60mg）与化疗（DTIC/TMZ）的无进展生存率（PFS），并通过全外显子测序（WES）和转录组测序（RNAseq）研究了基线转移肿瘤样本。这些研究者将组学数据与总生存期（OS）相关联，并与TCGA的mUM和原发性肿瘤进行比较。
在46例患者中，肝转移和LDH升高分别占96%和63%。毒性与以前的CABO和化疗报告相似。由于中期分析时PFS（p=0.964；HR=0.99）或OS（p=0.580；HR=1.21）均无差异，该试验已停止入组。在A091201研究中，WES显示肿瘤突变负荷为46±4，1年后OS曲线并无明显分离。已知突变包括GNAQ/11、SF3b1、BAP1；新突变包括GOLGA6l10、PKD1L3和FAM228B。A091201和TCGA队列的基因表达特征在MET信号、T细胞炎症、同源重组缺陷、增殖和低氧等存在显著差异。
| 基因表达特征 | 差异 |
|---|---|
| MET信号 | p=7.87e-22 |
| T细胞炎症 | p=0.004 |
| 同源重组缺陷 | p=0.004 |
| 增殖 | p=0.009 |
| 低氧 | p=5.2e-10 |
肿瘤免疫细胞富集分析显示，相对于TCGA，mUM组的M1:M2巨噬细胞较低，Tregs较高的患者有显著差异。在A091201中，上皮间充质转化基因表达特征与更差的OS显著相关，血管生成特征趋向显著。OS分离（OS≤1年）与血管生成/免疫相关分子neuropilin 1的表达增加相关。这项研究结果为原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤提供了有益信息。
